Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms