Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed5B2RPU8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed5B2RPU8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed5B2RPU8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zbed5B2RPU8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed5B2RPU8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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