Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms