Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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