Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syndig1A2ANU3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms