Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Padi1Q9Z185 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Padi1Q9Z185 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms