Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn13Q9Z0S4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms