Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sema6cQ9WTM3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sema6cQ9WTM3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms