Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nek3Q9R0A5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms