Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Snai3Q9QY31 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms