Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Copg2Q9QXK3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms