Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms