Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms