Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms