Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms