Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms