Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms