Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtf3c6Q9D8P7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtf3c6Q9D8P7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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