Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cyp2c55Q9D816 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cyp2c55Q9D816 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms