Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Borcs6Q9D6W8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms