Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3404Q9D506 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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