Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Phf6Q9D4J7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Phf6Q9D4J7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Phf6Q9D4J7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf6Q9D4J7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms