Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tubgcp4Q9D4F8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tubgcp4Q9D4F8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tubgcp4Q9D4F8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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