Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl28Q9D1B9 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms