Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc3Q9D114 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms