Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Utp23Q9CX11 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Utp23Q9CX11 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms