Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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