Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MINDY3Q9CV28 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms