Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rprd1bQ9CSU0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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