Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms