Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms