Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms