Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctu1Q99J10 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms