Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms