Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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