Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms