Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms