Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp20Q8C6M1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp20Q8C6M1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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