Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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FarsaQ8C0C7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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FarsaQ8C0C7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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FarsaQ8C0C7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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FarsaQ8C0C7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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FarsaQ8C0C7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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