Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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