Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms