Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Prpf40bQ80W14 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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