Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
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