Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf7ipQ7TT18 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms