Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms