Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Dsg1bQ7TSF1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Dsg1bQ7TSF1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Dsg1bQ7TSF1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Dsg1bQ7TSF1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Dsg1bQ7TSF1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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