Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrimpolQ6P1E7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms