Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atg9aQ68FE2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atg9aQ68FE2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atg9aQ68FE2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9aQ68FE2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms