Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Surf4Q64310 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms