Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms